Rainbow Six è il nome in codice di John Clark, "l'altra faccia di Jack Ryan", l'uomo che conduce le missioni in cui Ryan non può ufficialmente comparire. A capo di una task force internazionale supersegreta destinata alla lotta al terrorismo, si trova a fronteggiare una serie di avvenimenti esplosivi in diverse parti del mondo: un incidente in una banca svizzera, il rapimento di un importante uomo d'affari in Germania, un raid in un parco di divertimenti in Spagna. Sono solo le prime avvisaglie dell'entrata in azione di un gruppo di terroristi spietati, il cui successo potrebbe significare la distruzione del pianeta.